La qualità dell'acqua è un fattore fondamentale per la salute e il benessere degli organismi acquatici, compresi i pesci, le piante e gli invertebrati. L'acquario è un ambiente chiuso e artificiale, quindi è importante monitorare e mantenere la qualità dell'acqua per garantire la sopravvivenza e la prosperità degli organismi che vi abitano. I principali parametri da tenere sotto controllo sono: temperatura, pH, durezza, nitriti, nitrati e ammoniaca. La temperatura ideale per la maggior parte dei pesci tropicali è compresa tra 24 e 28 gradi Celsius. Il pH dovrebbe essere compreso tra 6,5 e 7,5. La durezza dell'acqua è misurata in gradi di durezza tedesca (dGH) e dovrebbe essere compresa tra 5 e 15 dGH. I nitriti e i nitrati sono prodotti di scarto del metabolismo dei pesci e possono essere tossici se presenti in concentrazioni elevate. L'ammoniaca è un composto altamente tossico per gli organismi acquatici e dovrebbe essere sempre mantenuta a livelli non rilevabili. Per mantenere la qualità dell'acqua è importante effettuare regolarmente dei cambi parziali d'acqua, utilizzare un filtro adeguato e somministrare il cibo ai pesci in modo corretto.